Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFQ10587 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFQ10587 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFQ10587 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms