Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms