Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms