Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms