Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms