Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms