Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms