Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms