Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms