Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms