Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VBP1P61758 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VBP1P61758 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VBP1P61758 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VBP1P61758 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VBP1P61758 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VBP1P61758 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VBP1P61758 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VBP1P61758 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VBP1P61758 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VBP1P61758 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VBP1P61758 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VBP1P61758 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VBP1P61758 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VBP1P61758 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VBP1P61758 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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