Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms