Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms