Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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