Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms