Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP4P49662 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms