Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPAP49450 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPAP49450 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms