Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD2P49005 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD2P49005 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD2P49005 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD2P49005 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD2P49005 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD2P49005 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD2P49005 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD2P49005 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD2P49005 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD2P49005 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms