Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPB2P35606 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPB2P35606 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPB2P35606 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPB2P35606 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms