Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms