Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFNP31947 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms