Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms