Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms