Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX2P28328 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX2P28328 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms