Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms