Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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