Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD53P19397 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms