Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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