Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms