Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RARBP10826 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RARBP10826 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARBP10826 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RARBP10826 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms