Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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