Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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