Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms