Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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