Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms