Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL21O00585 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL21O00585 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL21O00585 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL21O00585 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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