Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms