Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NPIPB13A6NJU9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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