Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
A4D1N5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
A4D1N5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms