Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms