Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIAS3Q9Y6X2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms