Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLXND1Q9Y4D7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms