Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms