Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms