Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms