Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms