Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP4Q9P0V3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP4Q9P0V3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP4Q9P0V3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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