Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms