Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTLNQ9NXG0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms