Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms